Один раз в неделю нельзя. Вы должны выставить счет-фактуру не позже чем через 5 календарных дней с даты отгрузки (п. 3 ст. 168 НК РФ).

Кстати, да, при ежедневных многократных отгрузках, даже и в разные точки одного и того же покупателя, можно заполнять один счет-фактуру на все отгрузки, которые были в течение 1 дня.

Это было письмо Минфина от 02.05.2012 №03-07-09/44.