в 46ИФНС точно смена ликвидатора по личной ЭЦП нового ликвидатора не пройдет. уточняла, подтвердили, но сама не пробовала. Не хочется получить отказ)))
в общем пройдет назначение ликвидатора в компании по его личной ЭЦП если данное лицо является директором компании.

При смене ликвидатора при ликвидации ООО согласие прежнего ликвидатора получать не нужно, его желание на решение участников ООО никак не повлияет.
Участники ООО решили, назначили нового ликвидатора, новый ликвидатор подал документы в налоговую на внесение изменений в ЕГРЮЛ.

с таким наименованием вы не сможете зарегистрировать Ассоциацию в Москве или МО, Минюст не пропустит.

Как давно ликвидирован учредитель Учреждения?

проблема сейчас у вас в том, что ваши местные религиозные организации уже являются частью (то есть входят) в ЦРО, которая выдавала им разрешение при регистрации МРО и входить в другую ЦРО (в том числе как создавать новую ЦРО) они не могут. Уточню, что в вашем случае можно сделать

неадекватность специалистов Минюста преодолевается в некоторых случаях жалобой в Департамент) но клиенты редко идут на то, чтобы писать жалобы, им проще и быстрее согласиться со специалистом Минюста и сделать документы НКО в том виде, в котором просит специалист

Клиенты могут конечно  настаивать на чем угодно) но согласна с ЮристкА, зарегистрировать общественную организацию с такими ОКВЭД не реально, ну как минимум в общем порядке.
Ну если у вас будет какая-то поддержка при регистрации, то вполне можно зарегистрировать все что угодно))) главное поддержка))

высший орган - это главнее директора, так как директора назначает именно высший орган.
Чаще всего высший орган является коллегиальным, то есть состоит из 2 и более лиц, но бывает состоит из одного физ.лица, например в АНО высшим органом может быть Учредитель (один).

ну как же, это предусмотрено законом о некоммерческих организациях, там целая статья есть, которая так и называется - Статья 29. Высший орган управления некоммерческой организацией

то что будет разрешение от централизованной религиозной организации очень хорошо, так как без него думаю и в Крыму (как в Москве и МО) не зарегистрируют местную религиозную организацию. Но мне кажется здесь присутствует так же и политическая составляющая... открыто конечно об этом никто не скажет...
Но давайте посмотрим, что такое УПЦ КП - самопровозглашенная церковь, не признанная всем миром... раскольники
Мне кажется сложно будет зарегистрировать эту организацию, но конечно можете попробовать с разрешением от централизованной